Сюжет разворачивается с окончания фильма 1998 года — Годзилла на Брукленском мосту убита ракетами, выпущенными из истребителей. Доктор Нико Таттопулос предупреждает военных о том, что несколько яиц, отложенных Годзиллой могли уцелеть. Одно яйцо уцелело и из которого вылупляется детёныш. Маленький Зилла быстро растёт и достигает крупных размеров, став потенциальным оружием против других мутантов подробнее

Со времен кровавых событий, произошедших на планете-тюрьме, прошло уже двести лет. Группа молодых ученых, заручившись поддержкой военных, решается на опасный эксперимент. Они решают клонировать Эллен Рипли, и с помощью клона Эллен получить зародыш Чужого, чтобы изучить его в своих лабораториях. Но внезапно эксперимент выходит из-под контроля, зародыш неожиданно для ученых начинается самопроизвольно размножаться, порождая новую, невиданную до этого породу монстра – помесь Чужого и человека. Никто не знает, на что способен этот новый жуткий тип монстра.  подробнее