На далёкой планете Кибертрон существовала цветущая цивилизация разумных роботов Трансформеров, делящихся на солдатов Десептиконов и тружеников Автоботов. Лидер первых властолюбивый Мегатрон развязал войну с мирными соседями, которая, истощив энергоресурсы планеты, поставила цивилизацию Кибертрона на край гибели. В поисках новых источников энергии Автоботы с Оптимусом Праймом во главе направились в космос, но корабль взяли на абордаж враги, и он, потеряв управление, рухнул вместе со всеми на планету Земля.

Спустя четыре миллиона лет вулканическая деятельность восполняет энергоресурсы упавшего корабля, и с помощью особых систем роботы восстанавливаются. Возобновившееся противоборство (теперь уже за обильные источники энергии Земли) выходит на новый уровень с появлением гештальтов — роботов-колоссов, образуемых слиянием нескольких Трансформеров и являющихся качественно новыми созданиями, сила которых гораздо выше суммы сил их составляющих. В ответ на десептиконовского Девастатора на мобильной фабрике-крепости «Scramble City» (она же мегагигант Метроплекс) Автоботы разрабатывают своих гештальтов, обладающих особым качеством («scramble power»): когда один робот служит корпусом, другие могут при необходимости наращивать любую из его конечностей. Борьба идёт с переменным успехом...